法律分析：农村无证房屋并不一定是违法建筑，还应当客观考虑其无证是由于历史、风俗习惯等原因造成，综合考量房屋来源、房屋建设的时间和动机、使用情况、使用利益、当时的立法状况等因素。对于没有办理批建手续，但拥有选址意见书，符合宅基地使用标准等此类存在程序违法的建筑，不能随便认定为违建，应当要求其缴纳相关费用并补齐程序。
法律依据：《中华人民共和国城乡规划法》 第三条 城市和镇应当依照本法制定城市规划和镇规划。城市、镇规划区内的建设活动应当符合规划要求。
县级以上地方人民政府根据本地农村经济社会发展水平，按照因地制宜、切实可行的原则，确定应当制定乡规划、村庄规划的区域。在确定区域内的乡、村庄，应当依照本法制定规划，规划区内的乡、村庄建设应当符合规划要求。
县级以上地方人民政府鼓励、指导前款规定以外的区域的乡、村庄制定和实施乡规划、村庄规划。
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