公司合并协议效力应按下列标准予以认定：
1、行为人具有相应的民事行为能力；
2、意思表示真实；
3、不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
符合上述标准的，应认定为有效。公司合并协议本质上是一个合同，应当《民法典》相关规定认定效力。
一、房屋转让协议怎样写才有法律效力
有效的房屋转让协议书应当具备以下要件：1、房屋转让协议书是双方真实的意思表示；2、不违反法律法规的效力性强制性规定；3、没有违背公序良俗，侵犯他人的合法权益。
根据2021年实施的《民法典》第一百四十三条规定，具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
二、双方协议怎样写才具有法律效力
《民法典》第一百四十三条规定，双方的协议具备下列条件发生法律效力：（一）行为人具有相应的民事行为能力；（二）意思表示真实；（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。第一百五十三条规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。违背公序良俗的民事法律行为无效。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
第一百四十四条
无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。
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