利用MEGA6建立进化树
一.NCBI中选择Protein数据库,搜索PD-1相关蛋白
二.选择兴趣蛋白,在Send to选项中选择File-FASTA格式
三.下载安装MEGA6,刚刚下载的FASTA文件变为可读,双击用MEGA6打开
四.展开上图得到下图,至此蛋白序列成功输入MEGA
五.选择菜单栏上Alignment-Align by Clustalw进行蛋白序列比对
六.得到比对后结果,菜单栏-Data-Export Alignment输出比对结果, 得到MEGA6源
文件,接下来就可以进行进化树绘制
八.返回主程序界面,菜单栏选择Phylogeny-第二个选项Neighbor,选择刚刚输出的数据,在个性化界面按需要自己的做调整,最后得到所需进化树.
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