建议认真看书,活学活用,掌握真东西用到实际中才是目的,考试不是目的。一,概念题(每题2分,)
1.糖有氧氧化:葡萄糖在有氧条件下生成CO2,H2O,ATP的过程。分三步:第一步:细胞质中,G生成丙酮酸(6-8个ATP);第二步:线粒体中,丙酮酸生成乙酰CoA(6个ATP);第三步:线粒体中,TCA循环(12*2个ATP)。2.脂肪酸β-氧化:
进入线粒体的脂酰CoA在酶的作用下,从脂肪酸的β-碳原子开始,依次两个两个碳原子进行水解,这一过程称为β-氧化,具体步骤如下:即:脱氢→水化→脱氢→硫解1步生成FADH2,3步生成NADH。如此循环,全部生成乙酰CoA。
奇数碳脂肪酸β-氧化除乙酰CoA外,还生成1mol丙酰CoA。3.鸟氨酸循环:自己画图。
4.酮体:包括丙酮、β-羟基丁酸、乙酰乙酸。其前体是:乙酰CoA。酮体在肝内合成,肝外分解,分解产物为:乙酰CoA。乙酰CoA→→丙酮、乙酰乙酸、β-羟基丁酸→血运至组织细胞中→乙酰CoA→TCA酮体的生理意义:1、大量消耗脂肪酸时,肌肉使用酮体节约G;2、大量消耗脂肪酸时,脂肪酸在血液中只能升高5倍,但是酮体可以升高20倍;3、酮体溶于水,易扩散进入肌细胞,脂肪酸则不能;4、大脑在饥饿时,可用酮体代替葡萄糖使用量的25%,在极度饥饿时,可达到75%;5、酮体是脂肪酸更有效的燃料。5.半保留复制:DNA复制,双链打开,以一条链为模板,分别复制出互补子代链。DNA复制出来的每个子代双链DNA分子中,都含有一半来自亲代的旧链和一条新合成的DNA链。6.核酸酶P:核酸酶P是专一的核糖核酸酶,催化大多数tRNA前体产生分子的5`端,切除前导序列形成pG,由RNA分子和一个蛋白质分子组成,保持完整的酶活性两者都需要。但催化亚基是RNA而不是蛋白质,蛋白质只起到保持RNA正确折叠和最大的催化活性。核酸酶P是一种具有工具酶一样催化活性的核酶。
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi7.中心法则:画图。
文字描述:大多数生物的遗传物质DNA和某些病毒的遗传物质RNA,通过复制把亲代的遗传信息传递到子代。DNA中的遗传信息还可以传递到RNA中(转录),并通过RNA再传递到蛋白质中(翻译)。在个别生物中遗传信息可以由RNA传递到DNA,即反转录.
8.联合脱氨基:氨基酸把氨基转给a-酮戊二酸转变成谷氨酸,然后在谷氨酸脱氢酶的作用下脱掉氨基。9.氮的正平衡:氮的征平衡是指生物体内摄入氮量大于排出的氮量。生长中的幼年动物,怀孕动物,哺乳动物,疾病恢复期的动物均处于氮的正平衡状态。10.糖异生:在肝脏中由非糖物质合成葡萄糖的过程
丙酮酸羧化酶生物素–ATP磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶传出线粒体到质中-GTP丙酮酸→草酰乙酸→苹果酸→草酰乙酸→PEG→2-P-甘油酸→3-P甘油酸→1,3-二磷酸甘油酸→3-P-甘油醛→+P-二羟丙酮→1,6-二磷酸果糖→6-P-F→
-ATP-NADH6-P-G→G
11.DNA的变性:DNA变性是指双螺旋之间氢键断裂,双螺旋解开,形成单链无规则线团,因而发生性质改变(如粘度下降,沉降速度增加,浮力上升,紫外吸收增加等),称为DNA变性。加热、改变DNA溶液的pH、或受有机溶剂(如乙醇、尿素、甲酰胺及丙酰胺等)等理化因素的影响,均可使DNA变性。
12.性内切酶:生物体内能识别并切割特异的双链DNA序列的一种内切核酸酶。它可以将外来的DNA切断的酶,即能够异源DNA的侵入并使之失去活力,但对自己的DNA却无损害作用,这样可以保护细胞原有的遗传信息。由于这种切割作用是在DNA分子内部进行的,故名性内切酶。13.转氨酶:催化氨基酸和α-酮酸或醛酸之间的氨基转换反应,生成与原来的α-酮酸或醛酸相应的氨基酸,原来氨基酸转变成相应的酮酸。转氨酶催化的反应都是可逆的。转氨酶的辅基是磷酸吡哆醛或磷酸吡哆胺,两者在转氨基反应中可互相变换。
14.底物磷酸化:分解代谢过程中,底物因脱氢、脱水等作用而使能量在分子内部重新分布,形成高能磷酸化合物,然后将高能磷酸基团转移到ADP形成ATP的过程。例如在糖的分解代谢过程中,G3P脱氢并磷酸化生成BPG,在分子中形成一个高能磷酸基团,在酶的催化下,BPG可将高能磷酸基团转给ADP,生成3PG与ATP。又如2PG脱水生成PEP时,也能在分子内部形成一个高能磷酸基团,然后再转移到ADP生成ATP。15.氧化磷酸化:伴随生物氧化而生成ATP的过程。糖酵解和三羧酸循环产生的NADH和FADH2,不能被直接氧化。它们中H+和e-,都要通过一系列电子传递
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi体的传递,最终才能传递给氧。这些电子传递体在传递电子的过程中,它们的能量水平将逐步下降,所释放的能量一部分推动着磷酸化作用,使ADP和无机磷酸结合生成ATP。由于氧化作用和磷酸化作用同时进行,故名氧化磷酸化。由NADH氧化到生成水的过程中,发生三次磷酸化,并生成3分子ATP。由FADH2氧化到生成水的过程中,只发生二次磷酸化,只生成2分子ATP。16.磷酸戊糖途径:
第一阶段:不可逆的氧化阶段:生成5-磷酸核酮糖和NADPH和CO2。
第二阶段:可逆的非氧化阶段:磷酸己糖的再生3个五碳糖→2个6碳糖和+1个3碳糖。
17.遗传密码:是一种决定蛋白质肽链长短和氨基酸排列顺序、负荷着遗传信息的密码。遗传信息的载体是核酸,根据核酸的碱基排列顺序而合成蛋白质。(1)三个碱基合在一起(三联体密码)决定一个氨基酸。遗传密码通常以mRNA上的碱基排列来表示;(2)密码的解读是从mRNA上某一个固定的碱基排列开始的,按5′→3′的取向,每三个碱基为一区段进行解读的;(3)蛋白质合成的终止是由不对应任何氨基酸的无义密码子决定的;(4)三联体单位中三个碱基都不重复解读,密码子与密码子之间不存在多余的碱基;(5)有的氨基酸具有两种以上的密码子;(6)遗传密码对于所有生物都是共通的。18.移码突变:在正常的DNA分子中,1对或少数几对邻接的核苷酸的增加或减少,造成这一位置之后的一系列编码发生移位错误的改变,这种现象称移码突变。移码突变的结果将引起该段肽链的改变,而肽链的改变将引起蛋白质性质的改变,最终引起性状的变异。严重是会导致个体的死亡。19.糖酵解:糖酵解是在无氧条件下,一个分子葡萄糖降解成二个分子乳酸,同时产生ATP的过程。糖酵解在细胞质中进行,分四大部分12步反应。21.转录泡:在转录延长过程中,DNA双链需解开10-20bp,形成的局部单链区象一个小泡,故形象地称为转录泡。转录泡是指RNA聚合酶-DNA模板-转录产物RNA结合在一起形成的转录复合物。
22.Tm值:DNA熔解温度,指把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。
23.核糖体:核糖体是蛋白质合成的细胞器,原核生物的核糖体的沉降系数是70S,它能解离成一个大亚基(50S)和一个小亚基(30S)。30S亚基中含有21种蛋白质和一个16SrRNA分子(蛋白质起始时与mRNA配对)。50S亚基中含有34种蛋白质和2个RNA分子。(23S和5S)。真核细胞的核糖体沉降系数是80S,能解离成一个大亚基(60S)和一个小亚基(40S),小亚基中含有一个18SrRNA分子,大亚基中含有三个rRNA分子(28S,5.8S,5S)。24.引发体:由DnaB解螺旋酶和DnaG引物合成酶构成了复制体的一个基本功能单位成为引发体。引发体还包括一些辅助蛋白质。引发体能依赖ATP延复制叉运
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi动方向在DNA链上移动,并合成冈崎片段的RNA引物。
25.冈崎片断:DNA复制时在复制叉上一条新肽链是连续合成的,后随链的合成是以片段的方式合成的,人们称这种片段为冈崎片段。
26.丙氨酸-葡萄糖循环:在肌肉中,由G通过糖酵解途径生成的Py,与Glu通过转氨基作用生成Ala和αKG,Ala即被转运到肝中,在肝中与αKG通过转氨基作用又生成Py和Glu,其中Py通过糖异生作用生成G,G被运输到肌肉组织中再次进行糖酵解完成下一个循环。
二,填空题(每空1分,共50分)1.糖酵解有1步脱氢反应和2步底物磷酸化反应。2.18C(14C)的饱和脂肪酸经8次β氧化生成8个FADH28个NADH和146个ATP。
3.真核细胞mRNA5`端有m7G-5′-PPP-5′-Nm帽子结构。4.糖原分解的关键酶是磷酸化酶。琥珀酸脱氢酶的辅酶是FAD。5.丙酮酸转变成磷酸烯醇式丙酮酸时共消耗了2个ATP。
6.三羧酸循环中有2步脱羧反应,4步脱氢反应,1步底物磷酸化反应。7.氮的总平衡是指机体摄入的氮量约等于排出的氮量。8.LDL是由血液向肝外组织运输胆固醇。9.脂肪酸合成时所需的NADPH来自磷酸戊糖途径和柠檬酸穿梭。10.饥饿时大脑可以用酮体代替糖的需要。
11.降低血糖的激素是胰岛素,其主要作用是促进血糖进入组织细胞。12.PRPP的中文是5-P核糖-1-焦磷酸。hnRNA的中文是核不均一RNA。13.糖代谢为脂肪合成提供ATP,NADPH,甘油和乙酰CoA。14.主要的生物氧化途径是NADH和FADH2。
15.原核生物蛋白质合成起始氨基酸是N-甲酰甲硫氨酸,携带起始氨基酸的tRNA反密码子是5`CAU3`。琥珀酸脱氢酶的辅酶是FAD。16.奇数碳原子脂肪酸代谢的琥珀酰CoA可以进入三羧酸循环。17.丙酮酸脱氢酶系含丙酮酸脱羧酶,乙酰硫辛酸转移酶,二氢硫辛酸脱
2+
氢酶酶和6种辅酶。FADH2NADHTPPMgHSCoA硫辛酸19.酮体在肝脏合成而在肝外组织分解。
20.酪氨酸转变成延胡索酸和乙酰乙酸再生成糖和酮体。21.脂肪酸合成的原件是丙二酸单酰CoA。
22.HDL在肝脏形成,主要运输胆固醇。甘油先转变成P-二羟丙酮再进入糖代谢途径。磷酸戊糖途径不可逆的部分是由6-P-G脱氢酶催化。23.磷酸葡萄糖脱氢酶的受体是NADP+。谷氨酸脱氢反应中的氢的受体是NAD+和NADP+。
24.嘌呤在人体内的最终分解产物是尿酸。
25.肝肾以外的组织由于没有6-P-G酶而无法直接补充血糖。糖原分解的关键酶是磷酸化酶。
26.HDL是由肝外组织向肝中运输胆固醇。
27.糖代谢的3个交汇点是6-P-G,丙酮酸和3-P甘油醛。28.RNA聚合酶是由核心酶和σ亚基组成。
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi29.磷酸戊糖途径生成2NADPH和5-P核酮糖。
30.IMP是AMP和GMP的前体。PRPP是由5-P核糖合成的。31.尿素由2个氨和1个二氧化碳合成。32.柠檬酸激活乙酰辅酶A羧化酶的活性。
33.tRNA反密码子第一个碱基是I时能识别mRNA的密码子是A、U、C34.tRNA反密码子第一个碱基是A和C时只能识别一种密码子。
35.mRNA起始密码子前方的SD序列富含嘌呤能与30S小亚基16SrRNA形成氢键。
36.肽酰转移酶具有催化肽键形成和水解tRNA与肽链之间的键活性。37.遗传密码子有种,其中61种代表氨基酸。38.1个氨基酸与tRNA形成氨基酰-tRNA时消耗了2个ATP。39.大肠杆菌的三个起始因子是:IF1,IF2,IF3。三、问答题
1.简述一分子葡萄糖生成2分子丙酮酸的过程和2分子丙酮酸生成一分子葡萄糖的过程中参与的酶及能量的异同点。(自己画图)答:
2.简述DNA合成的准确性是如何保证的。答:1、具有3΄→5΄外切酶活性的DNA聚合酶是保证DNA复制真实性的主要因素。酶可以切除参入的错误碱基。DNA聚合酶Ⅰ和Ⅲ具有这种纠正功能。2、复制体的组成复杂性。复制体是由大量的各种不同的酶的蛋白质组成的聚集物,这些成分在性质和活性上相互依赖。这样形成的网络的复杂性有助于保证所有的反应过程都是以极高的精确性进行。(DnaABCSSBATPDnaGTopoⅡHu)3、使用RNA引物而不是DNA引物。复制的早期阶段最易发生碱基参入错误。RNA引物可通过DNA聚合酶Ⅰ的5΄→3΄外切活性和5΄→3΄聚合酶活性切除RNA引物,并以脱氧核苷酸替代,从而可以消除最初阶段所出现的错误。4、具有多种修复被损坏的DNA的机制。光恢复、切除、重组修复、错配修复、SOS修复等。3.讨论苯丙氨酸的代谢途径,解释苯丙氨酸是生糖兼生酮氨基酸。答:
甲状腺素去甲肾上腺素→儿茶酚胺↑脱羧↑
苯丙酮酸←苯丙氨酸→酪氨酸→多巴胺类→儿茶酚胺
脱氨基↓↓对羟基苯丙酮酸黑色素
↓尿黑酸↓↓延胡索酸乙酰乙酸
乙酰乙酸属于酮体,因此苯丙氨酸可转变为酮体→生酮氨基酸
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi另一产物延胡索酸作为TCA循环中间产物,可异生为葡萄糖,因此苯丙氨酸也可以称为生糖氨基酸。
4.讨论进食,轻度饥饿、极度饥饿三种状态下大脑、肝脏、肌肉和脂肪组织的糖、脂肪及氨基酸的代谢特点。答:刚进食(血糖高)轻度饥饿(低血糖)饥饿大脑G→ATP糖异生→G→ATPG→ATP;酮体→ATP
FFAβ-氧化→乙酰CoA→TCA肝脏G→ATP;G→糖原;糖原→G→血糖
→酮体→各组织甘油+脂肪酸→脂肪脂肪分解→脂肪酸→β-氧化(已无糖原)利用氨基酸糖异生肌肉G→ATP(有氧);
G→乳酸(局部无氧)G→肌糖元
脂肪组织:脂肪合成
FFA→ATP
酮体→乙酰CoA→ATP
脂肪分解→FFA
FFA→ATP
酮体→乙酰CoA
肌蛋白→氨基酸→(肝)糖异生脂肪分解→FFA
5.尿素分子中一分子氨来自天冬氨酸时,鸟氨酸循环和柠檬酸循环及氨基酸转氨基作用是如何联系起来的。答:自己在旁边画图。
1.氨基酸和α-酮戊二酸在转氨酶作用下生成谷氨酸和α-酮酸2.在精氨基琥珀酸生成精氨酸的过程中脱下1分子的延胡索酸,延胡索酸又可以转化为苹果酸进入TCA循环。
3.转氨基作用和TCA循环产生的谷氨酸和草酰乙酸可以生成天冬氨酸再次进入尿循环。
6.简述蛋白质合成过程。答:1、氨基酸的活化。
2、蛋白质起始复合体的形成:
a.30S小亚基首先与IF1和IF3结合,IF3阻碍30S和50S亚基的过早结合,并促进70S核糖体亚基的解离。IF1的主要功能是增强IF2和IF3的活化。b.30S复合体的形成。mRNA的SD序列与小亚基的16SrRNA富含嘧啶区结合。IF2和GTP结合后再与30S小亚基结合,然后与fMet-tRNA结合,组成更大的复合体。复合体通过小亚基的16SrRNA和mRNA的SD序列之间的配对起作用。c.30S起始复合体与50S亚基结合形成70S起始复合体。同时IF1,IF3解离,GTP与IF2结合并水解成GDP和Pi,GDP/IF-2复合物从核糖体释放出来。起始密码AUG和fMet-tRNAfMet的反密码子配对的位置就是核糖体的P位。3、肽链延伸:
a、进入:是氨基酰-tRNA与核糖体A位结合。EF-Tu与GTP结合,再与氨基酰
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi-tRNA结合成三元复合物,这个三元复合物进入70s核糖体的A位。一旦氨基酰-tRNA进入A位GTP水解成GDP和Pi,EF-Tu和GDP复合物从核糖体释放出来。释放的EF-Tu和GDP将在EF-Ts作用下再生成EF-Tu·GTP,再与另一个氨基酰-tRNA结合,这样的一个循环过程叫Ts循环。EF-Tu·GTP和EF-Tu·GDP复合体仅能存在千分之几秒,这段时间提供了密码子——反密码子相互作用的时机,校读就发生在这一时刻,不正确荷载的氨基酰-tRNA将被解离。EF-Tu不与无负荷的tRNA或fMet-tRNA形成复合体。
b、转肽:是核糖体上A位和P位上的氨基酸间形成肽键。第一个肽键的形成是甲酰甲硫氨酰基从其tRNA上转移到第二个氨基酸氨基上形成的。在A位上形成二肽酰-tRNA,P位上仍然结合着无负荷的tRNA。催化肽键形成的酶称为肽酰转移酶,存在于大亚基中。
c、移位需要GTP水解,移位酶EF-G结构改变,进而促使核糖体结构改变,促进移位.。移位发生三个动作:1、P位上无负载的tRNA脱落;2、二肽酰-tRNA从A位→P位;3、mRNA移动三个核苷酸。
移位后A位空出准备结合下一个氨基酰-tRNA4、合成终止
A位上出现UAA,UAG,UGA时氨基酰-tRNA不能结合。释放因子识别终止信号。
A位上终止信号与释放因子结合,肽酰转移酶构象改变具有了水解活性:水解tRNA与肽链之间的键使多肽链释放;mRNA,tRNA脱落;70S分解成50S大亚基和30S小亚基。
真核中具有一个终止因子,即eRF,它可识别3个终止密码。eRF需要GTP与之结合才能结合核糖体,GTP在终止反应后被水解。
5、修饰:切除部分肽段;在特定氨基酸残基的侧链上添加一些基团;插入辅因子,还有些单肽需要聚合成多亚基蛋白。
综上,蛋白质合成是一个耗能过程,每个AA-tRNA的合成要消耗两个高能磷酸键(不包括错误浪费);每增加一个AA需水解2个GTP(进入、移位)。整个肽链中的一个肽键生成至少需要4个高能磷酸键,每个高能磷酸键消耗不局限于一个反应中发挥作用,而在维持mRNA密码与蛋白质氨基酸正确线性关系。7.简述糖异生的生理意义。
答:糖异生作用:在肝脏中由非糖物质合成葡萄糖的过程。主要前体:乳酸、氨基酸类、甘油、丙氨酸主要进入点:丙酮酸、草酰乙酸、P-2羟丙酮。生理学意义:a.非糖物质为机体提供糖牛羊等动物体内糖主要靠糖异生作用
马驴兔等体内糖相当大的程度上靠糖异生作用所有家畜饥饿或糖摄入不足时,靠糖异生作用获得葡萄糖,首先用于维持血糖浓度恒定。
b.清除家畜重役后产生的大量乳酸——防止酸中毒.
c.同时还可使不能直接补充血糖的肌糖原能够转变成血糖。
8.简述糖酵解的生理意义。
答:在无氧或缺氧条件下(剧烈运动,重役及病理性休克等)为机体提供生命活动所需的能量,但是能量有限。
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi成熟的红细胞仅靠糖酵解来获得能量
9.简述磷酸戊糖途径的生理意义。
答:5-磷酸核糖为合成DNA和RNA等生物合成提供原料;
磷酸戊糖途径产生的NADPH用于还原性的生物合成(合成脂肪,维持还原型谷胱甘肽等);
己糖和戊糖的相互转变,磷酸戊糖途径与糖的有氧和无氧分解是相联系的磷酸戊糖途径与光合作用有密切关系;
磷酸戊糖途径产生的3碳糖,5碳糖,7碳糖都是光合作用的中间产物。10.简述蛋白质合成70S起始复合体的合成。答:见6题。
11.简述体内需要大量5-磷酸核糖时6-磷酸葡萄糖的代谢。
答:当机体细胞处于旺盛时期,需要5-P-核糖合成DNA和RNA前体,这是需要大量的6-P-G通过糖酵解途径生成6-P-F和3-P-甘油醛。再由转酮醇酶和转醛醇酶将2分子的6-P-F和1分子的3-P-甘油醛通过反向的磷酸戊糖可逆fe氧化途径变为3分子的5-P-核糖。
12.简述体内需要大量ATP时6-磷酸葡萄糖的代谢。
答:当体内需要大量ATP时,葡萄糖有氧氧化加快,6-P-G转变为丙酮酸,进而形成乙酰CoA进入TCA循环,产生能量。画图。
13.简述三羧酸循环。
答:画出图来,圆形环状图。
总反应式:乙酰CoA+3NAD++FAD++2H2O+ADP+Pi→2CO2+3(NADH+H+)+FADH2+ATP+CoA-SH少数反应不可逆,但方向进行,有三个限速酶:柠檬酸合成酶,异柠檬酸脱氢酶,α-酮戊二酸脱氢酶。
整个反应生成:CO22个,4对氢原子经呼吸链产生4分子水,但循环中消耗2分子水(柠檬酸合成,苹果酸合成各消耗1分子水)净剩2分子水,ATP12个。该循环不仅是糖彻底氧化分解的途径,也是脂肪,氨基酸及其他物质彻底氧化的必经途径;此循环产生ATP很多,在提供机体能量方面起着重要作用;该循环还为生物大分子(蛋白质、核酸)的合成提供了前体;循环中各成员从理论上是不消耗的,但是参与其他反应,也是不断消耗和产生的。
14.简述脂肪组织中的脂肪的代谢。
答:脂肪组织中因为缺少甘油激酶,不能用游离的甘油生成3-P甘油,因此不能利用游离的甘油来进行脂肪合成。因此需要由糖代谢中产生的磷酸二羟丙酮转变为3-P甘油被利用合成脂肪。自己图示完成循环图:
a、摄入食物时:血糖↑→脂肪合成↑血液b、饥饿:血糖↓→合成↓,分解↑→FFA↑→组织细胞(肌肉)利用
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi15.简述脱氧核糖核酸的合成。四种脱氧核糖核苷酸的合成?答:脱氧核糖核苷酸是核糖核苷酸还原形成的。a、dATP,dGTP,dCTP的合成
二磷酸核苷酸还原酶NDP
→
谷氧还蛋白(还)→氧化谷胱甘肽→NADPH→dADP+ATP→dATPdCDP+ATP→dCTP
dNDP
谷氧还蛋白(氧)还原谷胱甘肽NADP+
dGDP+ATP→dGTPdUDP+ATP→dUTP
b、dTTP的合成
dUDP+ADP→dUMP+ATP
dUMP+HF4→dTMP→dTDP→dTTP
-ATP-ATP16.简述糖代谢为脂肪合成提供所有的原料。答:从以下四方面论述。甘油
乙酰CoANADPHATP
17.简述冈崎片段的加工。
答:后随链的合成是与复制移动方向相反的方向不连续合成。二聚体DNA聚合酶Ⅲ和一些专一的蛋白质参与这一合成过程。聚合酶Ⅲ的一个单体催化后随链的复制,另一个催化前导链的复制。后随链模板绕成一个环,这样两条亲代链就可以同一方向通过聚合酶。引物酶与后随链模板上的预引物蛋白形成引发体。引发体催化RNA引物的合成。引发体以5΄→3΄方向和复制叉移动保持同步,沿着后随链模板移动,由于它的移动,引发体促使引物酶间断地合成一段短的RNA,然后DNA聚合酶Ⅲ在引物上延伸DNA。合成一些短的DNA片段,称为冈崎(Okazaki)片段。引物酶合成方向与DNA聚合酶Ⅲ合成方向相反。当一段新的冈崎片段合成后DNA聚合酶Ⅰ利用5΄→3΄外切酶活性将RNA引物切除,又用同一酶再合成一段DNA作为替换,留下的缺口由DNA连接酶连接住封口。18.简述细胞能量对糖酵解的。
答:ATP↑→抑制磷酸果糖激酶活性ADP、AMP→激活磷酸果糖激酶通过调节糖酵解中的第三步6-P-F→1,6-二磷酸果糖
-ATP对糖酵解进行。
19.简述氨基酸脱羧后的碳架的去向。应该举例。
答:氨基酸碳架的去向是形成主要代谢中间产物,最后这些中间代谢产物转变为葡萄糖或被三羧酸循环氧化。分属各组的20种氨基酸的碳架集中成7种分子。
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi丙酮酸、乙酰CoA、乙酰乙酸、α-酮戊二酸、琥珀酰CoA、延胡索酸和草酰乙酸。
降解为乙酰CoA或乙酰乙酸的氨基酸,最后能生成酮体。
降解为丙酮酸、α-酮戊二酸、琥珀酰CoA、延胡索酸或草酰乙酸的氨基酸最后都能生成G,这些三羧酸循环的中间产物和丙酮酸都能转变为PEP,然后通过糖异生作用生成G。
亮氨酸和赖氨酸是生酮氨基酸,苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸和异亮氨酸既是生酮氨基酸又是生糖氨基酸。其余均为生糖氨基酸。
20.简述体内需要大量NADPH时6-磷酸葡萄糖的代谢。答:6-P-G通过磷酸戊糖途径在氧化阶段形成2分子NADPH和1分子5-P-核糖,5-P-核糖又可由转酮醇酶和转醛醇酶转变为6-P-F和3-P-甘油醛,而6-P-F和3-P-甘油醛可通过糖异生途径形成6-P-G。
21.简述核糖核酸的合成。答:
1、嘌呤核苷酸的生物合成:
嘌呤环是从氨基酸,四氢叶酸衍生物和二氧化碳合成的。5-磷酸核糖-1-焦磷酸(PRPP)的合成:
磷酸核糖焦磷酸激酶5-磷酸核糖+ATP→5-磷酸核糖-1-焦磷酸+AMP(消耗2个ATP)嘌呤环在组装过程中与核糖磷酸相连接5-磷酸核糖来自磷酸戊糖途径
2、嘧啶核苷酸的生物合成:
嘧啶环是由氨甲酰磷酸和天冬氨酸合成的,乳清酸从PRPP获得核糖磷酸部分,
核苷一磷酸,核苷二磷酸,核苷三磷酸可以相互转变。
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi22.简述4种脂蛋白的基本结构及其作用。
答:4种脂蛋白包含载脂蛋白、甘油三酯、磷脂、胆固醇及其酯等成分,形成大致球形结构。疏水的甘油三酯,胆固醇处于球的内核中,而兼有极性与非极性基团的载脂蛋白、磷脂和胆固醇以单分子层覆盖于脂蛋白的球表面,其非极性基团朝向疏水内核,而极性的基团朝向脂蛋白球外侧。乳糜颗粒(CM):把甘油三酯、胆固醇等从肠运输到脂肪组织和肝;极低密度脂蛋白(VLDL):由肝向肝外运输中性脂肪;低密度脂蛋白(LDL):把胆固醇运输到外围组织,并在这些地方进行胆固醇的从头合成(高,易患粥样硬化);高密度脂蛋白(HDL):由肝合成,把富含磷脂和胆固醇从外围组织运输到肝(高,不易患心血管病)。23.简述蛋白质合成过程中主要的参与因子。答:
a、起始因子:
IF1:IF1是一个小的碱性蛋白,它能增加IF2和IF3的活性。IF1与16SrRNA的结合位点在A位点。另外,IF1具有活化GTP酶的作用。
IF2:具有很强的GTP酶活性,在肽链合成起始时催化GTP水解。功能是生成IF2•GTP•fMet-tRNAMetf三元复合物,在IF3存在下,使起始tRNA与核糖体小亚基结合。
IF3:IF3与16SrRNA相互作用位点在P位点附近。IF3能通过促使mRNA的S-D序列与16SrRNA的3’-端碱基配对,让核糖体识别mRNA上的特异启动信号,又能刺激fMet-tRNAf与核糖体结合在AUG上。b、延伸因子:
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxiEF-Tu可与结合有氨基酰tRNA和GTP的核糖体形成四元复合物,同时偶联GTP的水解。随着氨基酰-tRNA与核糖体的结合,EF-Tu与GDP形成复合物离开核
EF-Ts负责催化EF-Tu-GTP的再形成,糖体。为结合下一个氨基酰-tRNA做准备。移位酶EF-G:结构改变。c、释放因子:
RF1:识别UAA、UAGRF2:识别UAA、UGA
RF3:激活RF1、RF2活性。
24.简述有氧或无氧的条件下3-磷酸甘油醛脱下的氢的去向及其意义。答:一、葡萄糖在无氧情况下进行糖酵解途径产能,简图如下:
G→→→1,6二P-F→3-P甘油醛(3-P甘油醛脱氢酶)→1,3二P甘油酸→→→→
NAD+→NADH→丙酮酸→乳酸
即在无氧条件下,3-磷酸甘油醛脱下的氢与受体NAD+结合生成NADH。为了使3-磷酸甘油醛继续氧化,必须提供氧化型的NAD+,丙酮酸生成乳酸的反应中,丙酮酸作为NADH的受氢体,使细胞在无氧条件下重新生成NAD+。由于糖酵解产生等摩尔的NADH和丙酮酸,每分子G产生的2个NADH分子都可以通过利用2个丙酮酸分子而重新被氧化,最后脱下的氢进入到了乳酸分子中。这种机制可以使得细胞在无氧条件下持续进行ATP的生成反应,即:使3-磷酸甘油醛持续氧化,完成糖酵解过程中耗能到产能的转折。
二、在有氧条件下,在细胞质中进行的由3-磷酸甘油醛脱氢产生1,3-二磷酸甘油酸,NAD+作为氢的受体形成NADH这一步产生的NADH,不再被后面形成的丙酮酸氧化,而是进入线粒体,实现NADH的氧化。
两种途径:一是通过磷酸甘油穿梭途径,将NADH电子转移进入电子传递链进行氧化磷酸化所利用的电子传递体是FAD,而不是NADH,因此最终每个细胞质中的NADH形成2个ATP;另一种为苹果酸-天冬氨酸穿梭途径,这种途径的最终结果是将细胞质中的NADH所带电子转移到线粒体基质内,为进入电子传递链创造条件。有氧条件下,NADH的氢(也就是3-磷酸甘油醛的氢)进入线粒体中,参与电子传递链,更高效的产能,同时后期产生的丙酮酸也不像无氧条件下被还原生成乳酸,而是进入TCA循环,同样高效产能。可见,有氧条件下这种机制有利于葡萄糖的彻底氧化与高效产能。
25.比较并讨论脂肪合成及脂肪分解的代谢途径。答:
区别点脂肪酸合成脂肪酸-氧化反应部位:细胞质线粒体酶7种多酶复合体4种是否多酶合体不明辅酶NADPHFADH2NADH二氢单位丙二酸单酰辅酶A乙酰辅酶A载体ACP辅酶底物转运柠檬酸穿梭作用肉碱转运脂肪分解:脂肪分解酶三酰甘油+3H2O→3FFA+甘油
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。NADH→NAD+
中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi甘油代谢:甘油→3-P甘油→P-二羟丙酮→1,6-二P-F→→→G
-ATP甘油→3-P甘油→P-二羟丙酮→丙酮酸→乙酰CoA→产能
-ATP+NADH5ATP3ATP12ATP共22ATP。脂酰CoA合成酶柠檬酸激活-2ATP脂肪酸代谢:a、活化:FFA→脂酰CoAb、脂酰CoA由肉碱转运到线粒体内膜c、β-氧化(肝):脱氢(FAD)、加水、脱氢(NAD+)、硫解(CoA)。
氧化过程中产生的FADH2和NADH通过呼吸链把它们的电子传递给O2,而硫解产生的乙酰CoA在正常情况下与草酰乙酸结合进入TCA循环。当草酰乙酸的量不够时(脂肪大量分解时),乙酰CoA就产生酮体,酮体是燃料分子。酮体可以在肝外组织被利用也可以转为乙酰CoA。乙酰CoA最终在肝外组织被合成脂肪或进入TCA。
脂肪合成:
脂肪酸合成:在细胞质中进行,因此位于线粒体内的乙酰CoA需要转运至细胞质中去→柠檬酸穿梭。(最好自己画图显示)转运一个乙酰CoA下消耗了2个ATP,产生了1个NADPH。
乙酰羧化酶柠檬酸激活–ATP羧化:乙酰CoA→丙二酸单酰CoA
通过酰基转移转移到酰基载体蛋白ACP上,形成丙二酸单酰ACP和乙酰ACP,二者经过缩合、还原、脱水、还原步骤形成丁酰ACP,以后各步都有丙二酸单酰ACP的加入,C链不段延长。到16C酰ACP时棕榈酰ACP硫解酶作用下,16C酰ACP分解为棕榈酸和HS-ACP。3-P甘油由P-二羟丙酮生成。
26.解释蛋白质合成中为何mRNA链中的AUG密码子不能被起始tRNA识读,而区别两种AUG密码子的结构基础是什么?答:
1.EF-Tu与GTP结合,再与氨基酰-tRNA结合成三元复合物,这个三元复合物进入70s核糖体的A位。EF-Tu不与无负荷的tRNA或fMet-tRNA形成复合体,因此fmet-tRNA无法进入A位。
2.mRNA起始密码AUG的前方富含嘌呤的SD序列与30S小亚基的16SrRNA结合,fmet-tRNA识别SD序列和AUG后结合到AUG密码子上。mRNA链中的AUG密码子前方没有SD序列fmet-tRNA不与链中的AUG密码子结合。3.起始因子IF1IF2IF3的作用形成正确的70s起始复合体.
27.简述DNA合成的起始
答:解开DNA螺旋有关的酶和蛋白质:
解链酶Rep、单链结合蛋白SSB、拓扑异构酶(解开超螺旋力)、引物酶:DnaG蛋白,合成RNA引物(primer)。复制的起始:
大肠杆菌复制起点称为为OriC,含有三个13bp的重复序列,四个9bp的重复序列。
DNA起始复合体的形成:
DNA缠绕大约20—40个DnaA蛋白各自带一个ATP,结合于四个9bp的序列,
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi其上,形成复合物。HU蛋白与DNA结合,促使双链DNA弯曲。受其影响三个富含AT的13bp序列被变性,称为开链复合物。
DnaB在DnaC的协助下结合于解链区。DnaB借助水解ATP产生的能量,5`→3`方向解开DNA的双链。在DnaB蛋白结合之后引物酶可以与DnaB蛋白结合,并合成RNA引物,提供游离的3`羟基。DNA双螺旋解开,分别以其中一条链为模板开始DNA新链的合成。此时形成一种动态的Y字形结构,称为复制叉。
28.简述RNA合成的起始
RNA合成需要;双链DNA、活化前提(NTP)、镁离子或锰离子、酶类。识别阶段:酶与启动子的结合(全酶)DNA链的局部打开转录的起始阶段:DNA摸板和RNA碱基配对
全酶中无σ亚基的酶称为核心酶,核心酶只能使已开始的RNA链延长,不具有起始合成RNA的能力,σ亚基称为起始亚基。
紧邻转录起始点的共有序列-10区是一个A/T富含区。1.σ亚基与核心酶结合形成RNA聚合酶全酶。
2.全酶以静电作用和启动子上游非特异性DNA结合。3.RNA聚合酶全酶沿DNA上下游动,包括共有序列在内与启动子特异性结合,全酶结合后引起DNA片段部分解链伸展开约11bp(从-9~+2)
4.酶与ATP或GTP结合,结合的三磷酸核苷酸形成转录物的5΄末端,刚结合上的三磷酸核苷3΄→OH与下一个核苷酸生成磷酸酯键。所以真核和原核生物的转录作用以A或G开始。
5.当全酶继续向下游移动,约有4个核苷酸与ATP(GTP)进行聚合。σ亚基从全酶上解离,核心酶继续合成。
新RNA链生长方向是5΄→3΄,新合成的RNA链与被转录的DNA链互补,反平行。
29.简述三大营养物的相互转换。答:
1、糖与脂肪的相互转换a、糖→脂肪
G→6-P-G→6-P-F→1,6-2P-F→P-二羟丙酮→3-P甘油→
↓羧化中性脂肪乙酰CoA→脂肪酸→
b、脂肪→糖
→甘油→3-P甘油→P-二羟丙酮→G脂肪活化,β-氧化→脂肪酸→乙酰CoA→×糖2、糖与蛋白质相互转换a、糖→蛋白质
G→丙酮酸→丙氨酸→
转氨基↓乙酰CoA非+必氨基酸→蛋白质
草酰乙酸→α-酮戊二酸→谷氨酸→b、氨基酸→糖糖异生氨基酸脱氨基→α-酮酸→G
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi3、脂肪与蛋白质相互转化a、氨基酸→脂肪
氨基酸脱氨基→α-酮酸→P-二羟丙酮→3-P甘油→
↓中性脂肪乙酰CoA→脂肪酸→
b、脂肪酸→氨基酸氨基化→甘油→3-P甘油→P-二羟丙酮→丙酮酸→丙甘酸脂肪
→FFA→乙酰CoA→×氨基酸
30.简述DNA聚合酶和RNA聚合酶的异同点。答:这两种聚合酶都可以5`→3`方向聚合合成核酸链,都需要镁离子参与,都生成PPi。
DNA聚合酶有5`→3`和3`→5`的外切活力,底物;dATP,dGTP,dCTP,dTTP,起始阶段需要RNA引物,半保留复制;
RNA聚合酶没有校正功能,也不需要引物,底物是NTP,全保留复制。
31.简述氨基酸的联合脱氨基过程。
答:联合脱氨基;氨基酸把氨基转给a-酮戊二酸转变成谷氨酸,然后在谷氨酸脱氢酶的作用下脱掉氨基。
32.简述tRNA的特点。
答:tRNA是分子量较小的单链RNA,一般含73-93个核苷酸,分子量为24000~31000U,但线粒体tRNA要小得多。
tRNA的三维结构不是三叶草型而是一个倒“L”型。tRNA有4个臂,分别叫做氨基酸臂,二氢嘧啶臂,反密码臂和TψC臂。氨基酸臂中3΄-端腺苷酸、2΄羟基或3΄-羟基与氨基酸的羧基成酯,反密码臂中的反密码子可识别mRNA中的密
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi码子。
tRNA在识别密码子上的作用
tRNA的接头作用:tRNA分子上与多肽合成有关的位点至少有4个3′端-CCA上的氨基酸接受位点识别氨基酰-tRNA合成酶的位点核糖体识别位点反密码子位点
tRNA分子的突变与校正功能:
校正突变发生在tRNA的反密码子在阅读mRNA的信息时发生了变化。33.简述大肠杆菌的DNA聚合酶的特点。答:
修复DNA的酶是Ⅰ型(单链多肽,10-20核苷酸/秒,具有5`→3`,3`→5`方向的外切活力),也有合成功能。
生理功能:修复DNA的损伤、DNA复制过程中切除RNA引物。Ⅱ型作用可能参与DNA的修复,无5`→3`外切活力
合成DNA链的聚合酶是Ⅲ型(1000核苷酸/秒,无5`→3`外切活力),加工能力极强,催化能力强,准确性高
DNA聚合酶Ⅲ型发挥作用时是二聚体,每个单体由10个不同亚基组成。34.乙酰辅酶A为什么单独不能合成葡萄糖?答:体内自身合成的葡萄糖须经过葡萄糖异生作用,而糖异生的主要切入点是丙酮酸、草酰乙酸和磷酸二羟丙酮,在体内代谢过程中与乙酰CoA相关的是丙酮酸和草酰乙酸。
在糖酵解与TCA循环途径中丙酮酸变为乙酰CoA是在丙酮酸脱氢酶系即3种酶和6种辅助因子的共同作用下完成的,其过程中生成1个NADH,且没有逆向的酶,是不可逆过程。即:乙酰CoA不能变成丙酮酸。故乙酰CoA不能从丙酮酸进入糖异生途径。
在TCA循环中虽然乙酰CoA和草酰乙酸结合生成柠檬酸,最后苹果酸脱氢生成草酰乙酸,草酰乙酸可以进入糖异生途径。但是乙酰CoA的加入伴随两个CO2离开TCA,草酰乙酸没有净生成。也就是说乙酰CoA不能转变为草酰乙酸进入糖异生途径。
35.简述核糖体的主要活性位点。
答:mRNA结合位点:位于30S亚基的16SrRNA上,3΄端有一富含嘧啶区可与mRNA上AUG之前的富含嘌呤区发生碱基配对,是30S亚基与mRNA正确结合不可缺少序列。
P位点:大部分位于30S亚基,小部分位于大亚基,能与起始tRNA-氨基酸结合,P位点也叫肽酰-tRNA位点。
A位点:主要位于50S亚基能与tRNA-氨基酸结合,A位点也叫氨基酰-tRNA位点。……
36.简述DNA的修复系统。答:
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi错配修复:DNA合成后亲代链充分甲基化,因为甲基化滞后于DNA合成。新的子代链在合成的大部分时间里,保持着非甲基化。这样模板链和新链之间就有区别,被识别的非甲基化序列作为修复的目标链。
光修复:由可见光(300-500nm)激活修复酶,该酶可使紫外线照射形成的嘧啶二聚体断裂。这种修复具有高度专一性。
切除修复:a、由特异性核酸内切酶在DNA损伤部位将DNA单链切断。b、核酸外切酶由5`-3`的方向,切除含有嘧啶二聚体的损伤片段c、以另一条链为模板,由DNA聚合酶在缺口处进行修复合成d、最后由连接酶将新合成的DNA链与原来的链接在一起。
重组修复:受到损害的DNA还能复制,这样受损亲代链的复制受到受损DNA的干扰,会出现一个缺口。这时:两条子代链相互作用,第二个子代分子中正常的姊妹链的相应片段插入子代分子中带有缺口的链。这样,可通过DNA多聚酶利用正常链做模板复制DNA来填补,连接酶封口,DNA得到修复。
SOS修复:当DNA损伤发生在不寻常的高水平时,DNA修复变得很不精确,产生高突变率,只有极少数突变体可以成活,只是一种应急反应。
37.简述真核生物mRNA转录后的加工。
答:真核生物mRNA初级转录物要经过剪接外显子、戴帽、多聚腺苷酸化等加工过程。
a.外显子剪接:
许多真核基因是以不连续基因或割裂基因出现。加工过程主要是切除内含子后连接外显子。它是由核内小RNA(snRNA)和核内小核糖核糖白(snRNP)聚集形成专一性很差的复合物,称剪接体。剪接体通过自身的snRNA和转录物之间碱基互补来识别剪接位点。
b.mRNA5΄端戴帽和3΄端加尾:
转录进行时5΄末端的修饰作用就立即开始,构成共转录加工加帽反应分四步进行。m7G-5′-PPP-5′-Nm,使mRNA免遭核酸酶的破坏;能使mRNA与核糖体小亚基结合,开始合成蛋白质;被蛋白质合成的起始因子识别,促进蛋白质合成。真核mRNA合成后还需要在3΄-OH端加上一个polyA尾巴。核酸内切酶从mRNA前体的高度保守的AAUAAA切割信号下游10~30个核苷酸的位点,然后在聚腺苷酸酶催化下加上polyA。polyA可保护mRNA的3΄-末端不会被核酸酶降解,并有助于mRNA从细胞核向胞浆转移。c、真核生物mRNA的甲基化修饰:
链内部往往有甲基化的碱基,这类修饰成分在hnRNA中已经存在,但有的真核生物细胞没有,所以这个修饰成分对翻译功能不是必须的。38.简述不同生物排氨的方式。答:
陆生脊椎:尿素
陆生爬行,鸟类,昆虫:尿酸鱼:氨。
39.简述酮体的代谢特点。自写。注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。中国农业大学生物化学习题(下)EditedbyLiLin&ZhangYanxi40.简述磷酸戊糖是如何参与嘌呤和嘧啶核苷酸的合成。答:
嘌呤环是从氨基酸,四氢叶酸衍生物和二氧化碳合成的
磷酸核糖焦磷酸激酶5-磷酸核糖+ATP——→5-磷酸核糖-1-焦磷酸+AMP(消耗2个ATP)嘌呤环在组装过程中与核糖磷酸相连接5-磷酸核糖来自磷酸戊糖途径
嘧啶环是由氨甲酰磷酸和天冬氨酸合成的乳清酸从PRPP获得核糖磷酸部分
核苷一磷酸,核苷二磷酸,核苷三磷酸可以相互转变
41.简述反转录病毒的特点。答:
1、反转录病毒借助于病毒颗粒的表面蛋白和跨膜蛋白,使病毒的基因组RNA及逆转录和整合需要的引物(tRNA和酶(转录酶、整合酶)进入宿主细胞。2、在引物和逆转录酶的作用下在宿主内由病毒RNA合成互补的DNA,之后该酶降解RNA-DNA杂交链中的的RNA链,并合成DNA链代替RNA链。
3、在整合酶的作用下病毒的双链DNA整合到宿主染色体DNA内,可随宿主染色体一起复制和转录。
4、转录后的病毒RNA进入宿主细胞质,翻译后蛋白质和基因组蛋白质转移到质膜,经装配通过出芽的形式形成新的病毒颗粒。
5、只有整合到宿主染色体上的病毒DNA转录和mRNA才有翻译产生蛋白质的活性,故逆转录是关键过程。
注:该习题基本是李赞东老师的出题题库,内部资料,仅供学习交流。
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