建设工程施工合同纠纷适用专属管辖，以其不动产所在地即建设工程所在地法院为管辖法院。建设施工合同并不属于一般的合同，根据法律规定，其按照不动产的纠纷处理模式，即适用专属管辖，不能协议管辖，只能由不动产所在地法院管辖。在确定管辖法院时候，专属管辖具有优先效力，排除协议管辖，排除一般和特殊地域管辖，也不适用于原告就被告的一般管辖规则。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民事诉讼法》
第三十三条因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。最高人民法院关于适用《中华人民共和国民事诉讼法》的解释第二十八条第二款农村土地承包经营合同纠纷、房屋租赁合同纠纷、建设工程施工合同纠纷、政策性房屋买卖合同纠纷，按照不动产纠纷确定管辖。