1、来源不同。白附子是植物独角莲的块茎，而附子是乌头子根经过加工的到的。
2、性味归经不同。白附子归胃、肝经，而附子归心、肾、脾经。
3、功能主治不同。白附子具有定惊解毒、祛风祛痰、散结止痛的功效，临床上常用来治疗中风痰壅、咽喉痛、偏头痛等等；附子的功效主要是回阳、散寒、止痛，临床上常用来治疗阳虚证、亡阳证等等。
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